Ανάλυση ακολουθιών βίντεο χρονοκαθυστέρησης βιολογικής οπτικής μικροσκοπίας κυττάρων στο σύννεφο
Σχετικά με το έργο:
Το έργο ABiOMiCeC επιδιώκει να μετασχηματίσει την επεξεργασία βιολογικών δεδομένων Cloud Computing μέσω βαθιάς μάθησης.
Η έρευνα του έργου επικεντρώνεται σε έρευνες υψηλής απόδοσης για την αποτελεσματικότητα της χημειοθεραπευτικής αγωγής και αποσκοπεί στη βελτίωση των διαδικασιών αξιολόγησης των φαρμάκων με μεγαλύτερη εξειδίκευση και λιγότερες ανεπιθύμητες ενέργειες.
Ερευνητές που απασχολούνται σε ακαδημαϊκά και επιστημονικά εργαστήρια, φαρμακευτική βιομηχανία, τμήματα κλινικής παθολογίας
Το κύριο παραδοτέο του έργου είναι το λογισμικό, το οποίο αποτελείται από τρία μέρη. Η πρώτη ενότητα εκτελεί προεπεξεργασία αφαιρώντας τα τεχνουργήματα εικόνας, αποκαθιστώντας τα δεδομένα μικροσκοπίας και δημιουργώντας εικόνες ψευδοφθορισμού από δεδομένα αντίθεσης φάσης. Η δεύτερη ενότητα αναλύει ταινίες time-lapse για τον εντοπισμό και την παρακολούθηση μιτωτικών και διαιρούμενων κυττάρων χρησιμοποιώντας τόσο επεξεργασία εικόνας όσο και βαθιά μάθηση, ενώ η τρίτη ενότητα παρακολουθεί την κίνηση των κυττάρων και ανιχνεύει κυτταρικά γεγονότα όπως η μετανάστευση και η απόπτωση για την υποστήριξη εφαρμογών διαλογής φαρμάκων.
Σύμπραξη:
Ομάδα έργου UoL:
Δρ Στάθης Χατζηδημητρίου είναι Αναπληρωτής Καθηγητής Επιστήμης Υπολογιστών και Τεχνολογιών Πληροφορικής και Διευθυντής του Μεταπτυχιακού Προγράμματος Σπουδών στην Επιστήμη Υπολογιστών και Τεχνολογίες Επιχειρήσεων στο Πανεπιστήμιο Λεμεσού. Είναι κάτοχος διδακτορικού διπλώματος στην Επιστήμη των Υπολογιστών από το Πανεπιστήμιο Columbia και έχει εκτεταμένη διδακτική εμπειρία στην επιστήμη των υπολογιστών, την ηλεκτρολογία και τη βιοϊατρική μηχανική. Η έρευνά του επικεντρώνεται στην ανάλυση βιοϊατρικών εικόνων, τη βιολογική μικροσκοπία και την ποσοτική μαγνητική τομογραφία για τον καρκίνο και τις νευρολογικές παθήσεις. Έχει παρουσιάσει το έργο του σε πολυάριθμα επιστημονικά συνέδρια και έχει δημοσιεύσει ευρέως σε διεθνή περιοδικά. Πριν από την ένταξή του στο UoL, κατείχε ερευνητικές θέσεις στο Πανεπιστήμιο Yale και συνεργάστηκε με πανεπιστημιακά νοσοκομεία στις ΗΠΑ και την Ευρώπη.
Δρ Luca Ferrarini είναι Επίκουρος Καθηγητής Πληροφορικής στο Πανεπιστήμιο Λεμεσού, με ειδίκευση στην ανάλυση δεδομένων και στους αλγορίθμους μηχανικής μάθησης. Είναι κάτοχος διδακτορικού διπλώματος στην Πληροφορική (με άριστα) από το Ιατρικό Κέντρο του Πανεπιστημίου Leiden στις Κάτω Χώρες, όπου η έρευνά του επικεντρώθηκε στην ανάπτυξη τεχνολογιών για την ανάλυση εικόνων μαγνητικής τομογραφίας του εγκεφάλου για την ανίχνευση δομικών αλλαγών που συνδέονται με νευροεκφυλιστικές ασθένειες. Ο Dr. Ferrarini έχει πάνω από δέκα χρόνια εμπειρίας ως διαχειριστής έργων και σύμβουλος ανάλυσης δεδομένων σε κορυφαίες εταιρείες πληροφορικής στην Ιταλία και την Κύπρο. Έχει δημοσιεύσει σε διεθνή επιστημονικά περιοδικά και συνέδρια με κριτές και είναι κριτής σε περιοδικά όπως το BMC Bioinformatics και το Journal of Alzheimer's Disease.
χρηματοδοτείται από:
Το έργο συγχρηματοδοτείται από την ΕΕ στο πλαίσιο του προγράμματος πολιτικής συνοχής "THALIA 2021-2027". [Pr. no. CONCEPT/0722/0065]. Το περιεχόμενο αντικατοπτρίζει τις απόψεις του/των συγγραφέα/ων και μόνο. Η Ευρωπαϊκή Επιτροπή και η Διαχειριστική Αρχή του προγράμματος THALIA 2021-2027 δεν φέρουν καμία ευθύνη για οποιαδήποτε χρήση των πληροφοριών που περιέχονται σε αυτό.
English (UK) 
Ελληνικά